La mayoría de las instalaciones en un sistema Windows dejan archivos atrás. Pueden ser archivos temporales, archivos que se han creado después de la instalación, archivos de configuración o archivos que se han añadido mediante parches. Las rutinas de desinstalación de archivos predeterminadas dejan archivos regularmente atrás. Esto puede evitarse utilizando desinstaladores especializados (como Revo Uninstaller) que analizan un sistema informático en busca de restos y los eliminan automáticamente.
Estos archivos pueden ser borrados manualmente también, pero esto usualmente pone el esfuerzo y el tiempo únicamente en el usuario. Una tercera posibilidad sería ejecutar Atomic Cleaner que viene con un modo para limpiar las sobras de juego de un sistema informático.
El Limpiador Atómico se parece a los limpiadores de sistemas habituales. No sólo puede limpiar las sobras del juego, sino que también proporciona acceso a archivos temporales y a un limpiador de Internet. Ofrece cuatro botones para iniciar las tres limpiezas diferentes y uno que iniciará una limpieza completa del sistema.

El usuario puede iniciar la limpieza inmediata del sistema seleccionando cualquiera de los cuatro botones principales o echando un vistazo en el menú avanzado. El menú avanzado proporciona opciones para escanear el sistema sin eliminar los datos inmediatamente. El Limpiador Atómico muestra una tabla después del escaneo que muestra el espacio que el usuario podría liberar si borrara los datos temporales en el sistema de la computadora.
El menú avanzado contiene la opción de añadir ubicaciones adicionales que deben limpiarse regularmente. Esta es una opción interesante para los usuarios que ejecutan aplicaciones que utilizan sus propias carpetas temporales para crear archivos en un sistema informático. La única opción que falta por completo es una para realizar las limpiezas del Registro.
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